Il disallineamento dell'Atlante ha quasi sempre un'origine traumatica. La causa più comune è il trauma da parto: durante il passaggio nel canale del parto, la prima vertebra cervicale può spostarsi dalla sua posizione fisiologica, talvolta in modo permanente.
Traumi successivi - come incidenti stradali, cadute accidentali o colpi di frusta - possono aggravare o causare ex novo il problema. Anche l'intubazione in anestesia generale rappresenta un fattore di rischio non trascurabile.
Il disallineamento non è equiparabile a una semplice contrattura muscolare e non può essere diagnosticato con una comune radiografia. Solo una TC spirale consente di visualizzarne con precisione la posizione rispetto al cranio.

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